funfoの売上とsquareの売上が合っていない

こちらは以下の2パターンのどちらかになっているとfunfoの売上とsquareの売上が一致しなくなります。

1. funfo上で伝票が赤伝処理されていて、square上では該当伝票の支払いが返金されていない場合
2. Square上で返金処理されていて、funfo上ではが該当支払いの伝票がまだ赤伝処理されていない場合

funfoのレシートボックスとsquareのお取引を確認し、相違があった部分を修正すれば、ずれが解消されると思います。